Ну проводи эксперимент
Я говорю как у меня было. Вот опять непонятно куда лезете, как и в ситуации с "грохотом подвески", который пропадает при торможении. При выжиме сцепы, когда коробка перестает работать, звук пропадает? Если да, то коробка, если нет, то не коробка. Чего гадать-то?